“虚增1339万研发成本，少缴184.94万企业所得税，最终被罚 323.41万”——国家税务总局2025年7月公开的陕西永明煤矿有限公司税务稽查案，堪称研发费用加计扣除违规的“教科书式反面案例”。在金税四期大数据监管全面收紧的当下，研发创新本是企业的“增长引擎”，研发费用加计扣除本是政策红利，但永明煤矿的惨痛经历却警示：若踩错合规红线，红利只会变成“埋雷”，千万研发投入终将被罚单吞噬。

从65%异常降幅到全员“兼职”：一场被大数据戳穿的合规谎言

这起案件的曝光，始于税收大数据的一次精准预警。陕西永明煤矿作为高新技术企业，已享受 15% 的企业所得税优惠税率，但税务部门通过数据分析发现，其在经营状况未发生明显变化的前提下，企业所得税年度申报额竟大幅下降 65%，这一降幅远超同行业税率优惠带来的合理波动范围，疑点直指研发费用加计扣除申报数据的真实性。

面对核查，企业辩称“研发投入大，合规享受优惠”，还以“煤炭行业安全规程严禁非专业人员下井”为由，拒绝检查人员实地查验井下研发项目。然而，税务部门并未就此止步，转而依法调取了该公司12个研发项目的立项决议、研发报告、物料领用单等备查资料，一场从纸面数据切入的深度核查就此展开，而企业精心伪装的“研发合规”假象，也随之层层破裂。

雷区一：研发团队“全员兼职 + 后勤凑数”，人员界定彻底失控

核查人员翻阅资料时发现，该公司研发人员费用归集表既无具体人员构成说明，也缺少明确薪酬发放记录。进一步调取花名册、工资表及考勤记录逐人核对后，惊人的事实浮出水面：12个研发项目竟无一名专职研发人员，全部由其他部门员工兼职，甚至将会计、人事等后勤人员纳入研发序列。某年度申报的70名研发人员中，13名是完全不直接从事研发活动的后勤人员。

企业辩称这些后勤人员参与了研发 “辅助工作”，但政策规定辅助人员不应包括为研发活动从事后勤服务的人员。更离谱的是，部分兼职人员的工时记录纯属虚构：兼职研发人员胡某某年度11月考勤仅16天参与研发，企业却将其当月全额薪资计入研发费用；张某某年度国庆期间差旅凭证显示在外省培训，考勤却记录在本地研发现场，薪资仍全额归集至研发成本。按照国家税务总局公告2017年第40号要求，兼职研发人员费用需按实际工时占比合理分配，未分配的不得加计扣除，而该公司完全无视这一规定。

雷区二：费用归集“张冠李戴”，93万企业年金+42万生产材料违规入账

在费用核查环节，两处关键违规让企业偷税事实无可辩驳。一是将93万元企业年金违规计入 “研发人员人工费用”。根据财税〔2015〕119 号文件，研发人员人工费用仅包含工资薪金、基本社保及住房公积金等，企业年金并不在列，即便符合规定的补充养老保险，也仅能作为“其他相关费用”限额列支，该企业却直接全额计入；二是通过篡改物料领用单，将42万元生产经营用钢材、电缆等材料，违规列入研发材料费用，虚增研发成本。

这并非个例，2025 年上半年税务稽查数据显示，“研发与生产费用界限不清”是最常见的违规类型，占比高达62%。很多企业抱有“都是公司开支，记哪都一样”的侥幸心理，却不知税务部门早已通过 “研发立-物料领用-生产消耗-成品入库”的数据链条，构建起完整监管闭环，任何混淆费用的操作都难逃精准识别。

雷区三：资料留存 “缺斤短两”，证据链断裂导致真实费用也无法抵扣

企业拒绝实地查验后，备查资料成为关键证据，但核查人员发现，12 个研发项目的相关资料残缺不全：部分项目缺少完整立项决议，费用分配说明仅笼统写“按比例分摊”，无工时分配表、项目费用归集表等核心依据，研发计划书、成果报告也存在缺失。

研发费用加计扣除相关涉税资料是证明研发支出真实性、合理性的核心凭证，即便该公司部分费用确实用于研发，但因资料不全、证据链断裂，最终仍被全额剔除优惠，可谓“做了研发却证明不了研发”。

处理结果：323.41 万全额追缴，偷税定性难逃惩戒

经税务部门查实，陕西永明煤矿通过扩大研发人员范围、虚列工时、违规归集费用等手段，累计违规虚增研发成本1339万元，少缴企业所得税184.94万元。依据《中华人民共和国税收征收管理法》，延安市税务局第二稽查局依法作出处理：追缴少缴税款 184.94 万元，加收滞纳金并处罚款，合计 323.41 万元。目前，涉案全部款项已追缴入库，企业财务负责人承认对政策理解存在偏差，但 “无心之失” 终究难逃法律惩戒。

破局：从“被动补锅”到“主动防控”，研发合规需全流程协同

陕西永明煤矿的案例绝非个例，其暴露的人员界定模糊、费用归集混乱、资料留存缺失等问题，在制造业、能源业等研发密集型企业中普遍存在。这起案件深刻警示：研发税务合规不是财务部门的 “独角戏”，而是贯穿研发项目“立项 - 实施 - 结题 - 归档”全流程的 “协同战”。金税四期时代，“纸面合规”早已失效，只有打通研发、人力、生产、财务的协同链路，才能筑牢合规防线。

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