注册税务师行业的发展、成熟，无疑既有利于税收征管，又有利于维护纳税人的合法权益，对推动我国依法治税，维护社会公共利益都有着非常重要的作用。但是，根据目前情况看，我国注册税务师行业的发展，存在着非常突出的几个矛盾。
    一、涉及社会公共利益面广与法律级次低的矛盾
    税收是社会公共利益的重要组成部分，作为一个国家，没有税收就没有公共利益。也就是说，社会公共利益是国家税收为基础的，因此税收本身是社会公共利益的保障。注册税务师行业作为一种专业服务于税收的社会中介行业，其主要职责是进行涉税鉴证，即通过其执业行为，判断纳税人涉税行为的真实性、合法性和完整性，为税务机关的判断提供依据，其次是在涉税市场业务中接受纳税人的委托，代理从事各项涉税事宜；第三是向纳税人提供税务咨询。可见，注册税务师行业贯穿于税收征纳的整个过程，其执业行为也就涉及到社会公共利益。
    注册税务师在从事其业务时，具有双重职责，主要是依法为委托人提供涉税服务，维护纳税人的合法权益；辅以监督税务机关的行政行为，维护国家税收权益。这种在税收征纳关系中的中介地位，要求注册税务师行业应该有法可依，通过法律的形式确定其地位、性质及基本的执业规范，以保证其坚持独立、客观、公正原则，以税法为准绳，以服务为宗旨，充分发挥其为委托人正确履行纳税义务、维护其合法权益服务，又为税务机关依法征税、维护国家权益发挥辅助和监督制约的作用。
    随着社会需求的增加，我国注册税务师行业得到了迅速壮大，据不完全统计，截至2004年9月底，全国通过考试取得注册税务师资格的已经有62000多人，其中执业注册税务师超过20000人。全国已有税务师事务所2600多家，从业人员6万多人，并且还以每年10%-20%的速度增加，随着我国税收服务市场的进一步开放，国外涉税服务的中介机构必将大量的进入对外开放、外资企业众多的中国。
    针对注册税务师行业涉及公共利益、服务于税收征管和纳税人以及目前及可预见的将来行业不断发展壮大的现实，都应当有相应的法律予以规范，以保证行业的利益、规范行业行为、调整各方利益，以充分发挥注册税务师行业的积极作用。但是，目前注册税务师行业依照的既没有法律，也没有行政法规，只有部门以“通知”发的“暂行规定”，法律层次之底，刚性之不强，可想而知，矛盾十分突出。
    二、行业发展与涉税法定业务面窄量少的矛盾
   目前我国有从事税收征管的税务干部近200万，但是由于征管技术落后、纳税人纳税意识淡薄等原因，征税成本高而征管质量低，这就需要注册税务师行业发挥涉税鉴证的职能，协助税收征管，通过独立、客观的执业行促进税法的贯彻落实。但是就目前情况看，注册税务师行业的涉税鉴证业务面很窄，从现行的规定看，只有少数企业所得税前扣除的财产损失列入了注册税务师鉴证的范围，对年末税收清算、企业所得税年度汇算、纳税情况审核等属鉴证的业务均以纳税人自行委托为前提，在我国征管力量严重不足，征管手段落后的情况下，纳税人偷漏税的风险成本几乎很小，难以形成自愿委托的动力和机制，造成注册税务师行业叫好不叫座，制约了行业的发展。因此，法定鉴证业务面窄量少与行业不断发展壮大之间的矛盾日益突出。
    三、鉴证业务的确定与机构设置不均衡的矛盾
    由于目前法定的涉税鉴证业务少，制约了注册税务师行业的发展，行业发展规模小造成部分落后地区难以覆盖，面广量大的法定涉税鉴证业务自然难以实行，注册税务师行业的主体是税务师事务所及其执业人员注册税务师，而税务师事务所是按市场的需要和调节建立的，在经济发达、集中地区也是税务师事务所较集中的地方，如甘肃省全省十四个地州市，税务师事务所42家，其中兰州市38家，其他地州市仅4家，由于分所审批设立的相关规定没有出台，一些地方就是空白，如果涉税鉴证业务面广，难免会出现纳税人找税务师事务所难的问题，因此，确定涉税鉴证业务与税务师事务所设立不均很的矛盾也比较突出。
    四、高质量的业务需求与执业人员业务素质低的矛盾
    如前所述，注册税务师行业是向纳税人提供税务代理、财税咨询和按规定鉴证纳税人涉税事项是否真实、合法、完整的经济鉴证类社会中介行业，无论是受纳税人委托从事税务代理、提供税务咨询服务，还是按规定进行涉税鉴证，都需要从业人员有较高的综合素质，能提供高质量的专业服务，但是，由于我国注册税务师行业是从简单的税务咨询发展起来的，起步阶段从业人员主体主要是从税务机关退休的职工和家属子女，从事的业务也是简单的审核、资料报送等简单的事务性工作，加上2000年脱钩改制，大部分税务师事务所是从原税务机关脱钩改制成立的，资料显示2004年末我国共有税务师事务所2600多家，从业的注册税务师（经考试取得资格）的人员23000人，平均每个所的执业注册税务师不到九人，注册税务师仅占6万从业人员的三分之一过一点，可见行业内从业人员的整体业务素质参差不齐，与社会对行业业务质量的要求不能适应。
    以上矛盾的存在，导致注册税务师行业存在社会认知度不够，行业发展无法可依，没有足够的涉税鉴证业务，难以发挥注册税务师行业的作用，不能达到降低征税成本、提高征管效率的目的，也制约了行业效益的提高，致使税务师事务所投入不足，高素质的人才难以引进，以及后续教育缺乏资金保证。